Ο Ιωάννης Βαθιώτης αποφοίτησε με «Άριστα» από την Ιατρική Σχολή του Εθνικού και Καποδιστριακού Πανεπιστημίου Αθηνών (ΕΚΠΑ) το 2014. Από το 2015 έως το 2018 εκπαιδεύτηκε στην Παθολογία στη Γ’ Παθολογική Κλινική ΕΚΠΑ, Γενικό Νοσοκομείο Νοσημάτων Θώρακος Αθηνών “Η Σωτηρία”. Το 2017 ολοκλήρωσε με «Άριστα» το. Πρόγραμμα Μεταπτυχιακών Σπουδών του ΕΚΠΑ «Ογκολογία Θώρακα: Σύγχρονη Κλινικοεργαστηριακή Προσέγγιση και Έρευνα». Ακολούθως, μετέβη στις ΗΠΑ όπου εργάστηκε ως μεταδιδακτορικός ερευνητής στο Πανεπιστήμιο Yale, New Haven, CT με. αντικείμενο την ανακάλυψη και επικύρωση βιοδεικτών για τους ασθενείς με συμπαγείς όγκους (2018-2020), λαμβάνοντας υποτροφία από την Εταιρεία Ογκολόγων Παθολόγων Ελλάδας (ΕΟΠΕ). Από το 2021 συνέχισε την εκπαίδευσή του στην Παθολογική Ογκολογία στη Γ’ Παθολογική Κλινική ΕΚΠΑ, Γενικό Νοσοκομείο Νοσημάτων Θώρακος Αθηνών “Η Σωτηρία”. Το 2022, μετέβη εκ νέου στις ΗΠΑ και συγκεκριμένα στο Πανεπιστήμιο Thomas Jefferson, Philadelphia, PA, όπου και εξειδικεύθηκε στους όγκους θώρακα και κεφαλής και τραχήλου. Το 2023, ολοκλήρωσε με «Άριστα» τη διδακτορική του διατριβή στο ΕΚΠΑ με. τίτλο «Προβλεπτικά μοντέλα/υπογραφές για την ανταπόκριση στην ανοσοθεραπεία σε ασθενείς με μελάνωμα».

Από το 2024 είναι κάτοχος του τίτλου ιατρικής ειδικότητας της Παθολογικής Ογκολογίας και εργάζεται ως επιστημονικός συνεργάτης στη Γ’ Παθολογική Κλινική ΕΚΠΑ. Είναι υπεύθυνος του Ερευνητικού Εργαστηρίου και συντονιστής του Ογκολογικού Συμβουλίου της Κλινικής. Έχει συμμετοχή σε πολλαπλές κλινικές μελέτες φάσης ΙΒ-ΙV. Συμμετέχει στην προπτυχιακή εκπαίδευση φοιτητών ιατρικής και οδοντιατρικής του ΕΚΠΑ και είναι μέλος της επιτροπής εκπαίδευσης και εξετάσεων δύο ΠΜΣ του ΕΚΠΑ. Έχει πάνω από 70 δημοσιεύσεις σε διεθνή περιοδικά και είναι συγγραφέας σε δύο διεθνή ιατρικά συγγράμματα. Είναι κριτής εργασιών (Reviewer) σε πολλά διεθνή και ελληνικά περιοδικά. Είναι μέλος της
συντακτικής ομάδας του περιοδικού ΠΝΟΕΣ της Ελληνικής Εταιρείας Καρκίνου του Πνεύμονα (ΕΛΕΚΑΠ). Έχει διατελέσει προσκεκλημένος ομιλητής και πρόεδρος σε πολλά
διεθνή και ελληνικά συνέδρια. Είναι μέλος διεθνών και εθνικών ιατρικών επιστημονικών ομάδων συμπεριλαμβανομένων των International Association for the Study of Lung Cancer (IASLC), European Society of Medical Oncology (ESMO), American Society of Clinical Oncology (ASCO), Ομάδα Νέων Ελλήνων Ογκολόγων (ΟΝΕΟ), ΕΟΠΕ και ΕΛΕΚΑΠ.